美國聯邦地區法院法官艾莉森·伯勒斯（Allison Burroughs）6月20日再次簽發臨時禁令，阻止國土安全部吊銷哈佛大學招收國際學生資格，確保其繼續為海外學生簽發I-20等簽證文件。 5月，美國國土安全部長克里斯蒂·諾姆（Kristi Noem）以哈佛未充分配合白宮整頓校園抗議、招生和僱傭政策為由，撤銷其學生與交流訪問學者計畫（SEVP）認證，迫使約7,000名國際生（佔全校四分之一）面臨轉學或非法居留風險。

6月川普又援引新法律理由，試圖全面禁止新留學生入境哈佛。哈佛隨即兩度起訴，指控政府報復拒絕美國政府的保守議程，並強調沒有國際學生，哈佛就不是哈佛。校方稱，制裁已削減26億美元研究經費、終止聯邦合約並威脅取消免稅地位，令全球招生受損並製造極度恐慌與混亂。伯勒斯裁定相關措施在案件審結前暫停執行，但警告爭端並未終止。哈佛校長艾倫·加伯（Alan Garber）表示，哈佛將繼續打擊反猶太言論，同時捍衛受法律保護的學術自由與多元原則。

2025年4月15日，美國麻薩諸塞州劍橋市哈佛大學商學院校園景觀（Reuters/Faith Ninivaggi）