澳洲多所大學關閉或調整孔子學院，引發對外來干涉的擔憂。 RMIT於2021年因疫情影響關閉其孔子學院。研究孔子學院的弗林德斯大學學者傑弗裡·吉爾（Jeffrey Gill）表示，此舉並不意外。隨著澳中關係趨緊及美歐部分孔院的關閉，孔子學院在澳洲的吸引力和可行性受到削弱。政府對外國勢力幹預的擔憂或大學不續約的一大因素，部分美國大學已因政府撤資而取消孔院，以免受影響。吉爾指出，孔院雖未明確傳播政治宣傳，卻常迴避對中國的負面話題，其對西方社會公眾對華觀感的影響也十分有限。

儘管近年來孔院總數驟減，紐卡斯爾大學、雪梨大學、昆士蘭科技大學、格里菲斯大學、拉籌伯大學、維多利亞大學及查爾斯達爾文大學仍在運作孔院。各校多強調其語言與文化推廣作用，並遵守澳方政策及外來影響透明製度。反對黨先前也曾敦促各大學謹慎考慮孔院是否符合其價值觀。

昆士蘭大學發言人表示，該校已於去年底與天津大學達成協議，將在該校開設孔子學院（圖片來源: ABC News: Giulio Saggin）